Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2AQ12879 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
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