Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIF5AQ12840 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIF5AQ12840 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms