Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BPTFQ12830 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BPTFQ12830 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms