Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
KCNMA1Q12791 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNMA1Q12791 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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