Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGNL1Q0VF96 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms