Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCBP1Q09161 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCBP1Q09161 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms