Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL1Q08397 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL1Q08397 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms