Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GOLGA3Q08378 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GOLGA3Q08378 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms