Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFF3Q07654 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms