Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABPAQ06546 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPAQ06546 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms