Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIN1Q05586 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIN1Q05586 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms