Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ERCC6Q03468 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
ERCC6Q03468 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms