Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPCQ03188 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPCQ03188 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms