Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ID3Q02535 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ID3Q02535 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ID3Q02535 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ID3Q02535 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ID3Q02535 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ID3Q02535 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ID3Q02535 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ID3Q02535 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ID3Q02535 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ID3Q02535 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ID3Q02535 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ID3Q02535 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms