Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPIBQ01892 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms