Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFITM3Q01628 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms