Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF2Q01130 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms