Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MDM2Q00987 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms