Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSF1Q00613 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms