Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HBG1P69891 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HBG1P69891 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HBG1P69891 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HBG1P69891 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBG1P69891 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBG1P69891 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBG1P69891 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBG1P69891 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBG1P69891 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBG1P69891 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBG1P69891 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBG1P69891 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBG1P69891 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBG1P69891 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HBG1P69891 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms