Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBB4BP68371 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms