Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTG1P63261 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms