Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC01547P58512 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms