Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM3BP58499 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms