Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EEFSECP57772 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms