Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAX9P55771 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAX9P55771 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PAX9P55771 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms