Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRPF1P55201 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms