Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP1B3P54709 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms