Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP2S1P53680 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms