Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDST1P52848 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDST1P52848 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDST1P52848 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDST1P52848 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDST1P52848 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms