Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK4P51957 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK4P51957 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms