Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP11P51784 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP11P51784 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP11P51784 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP11P51784 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP11P51784 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP11P51784 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP11P51784 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP11P51784 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP11P51784 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP11P51784 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP11P51784 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP11P51784 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP11P51784 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP11P51784 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP11P51784 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms