Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TTPAP49638 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TTPAP49638 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TTPAP49638 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TTPAP49638 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms