Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSR1P43307 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSR1P43307 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSR1P43307 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSR1P43307 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSR1P43307 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSR1P43307 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSR1P43307 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSR1P43307 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSR1P43307 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSR1P43307 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSR1P43307 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSR1P43307 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSR1P43307 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSR1P43307 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms