Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIK3CBP42338 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms