Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms