Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GJC1P36383 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GJC1P36383 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GJC1P36383 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms