Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTNNB1P35222 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms