Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJA4P35212 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms