Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCM5P33992 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCM5P33992 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MCM5P33992 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MCM5P33992 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms