Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCC1P33527 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms