Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP1P30622 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms