Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms