Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5AP29375 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5AP29375 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms