Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PLNP26678 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PLNP26678 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PLNP26678 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PLNP26678 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PLNP26678 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PLNP26678 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PLNP26678 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PLNP26678 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PLNP26678 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PLNP26678 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms