Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MSR1P21757 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MSR1P21757 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MSR1P21757 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MSR1P21757 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MSR1P21757 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MSR1P21757 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms