Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXA5P20719 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXA5P20719 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms