Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RAB4AP20338 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB4AP20338 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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