Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRB1P17538 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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