Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNRPBP14678 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms